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怎么用r语言统计相同id出现的频率 -尊龙凯时网址

2023-06-06

本篇内容介绍了“怎么用r语言统计相同id出现的频率”的有关知识,在实际案例的操作过程中,不少人都会遇到这样的困境,接下来就让小编带领大家学习一下如何处理这些情况吧!希望大家仔细阅读,能够学有所成!

r语言代码,统计向量的频次,其实很简单,用table方法一步就完成,后面就是绘图了:

注意本代码的主题为cowplot主题适合sci文章发表,并设置了柱状图上加数字。

library(reshape2)
local({r <- getoption("repos")  ;r["cran"] <- "http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/cran/" ;options(repos=r)}) 
library(ggplot2)
library(cowplot)
library(rcolorbrewer)
pairjoin <- function(x){ 
  ran=x
  ran[length(ran)]=">=11"
  ran=ran[-1]
  ran
}
#统计频率,并把大于11的 归类到一起:
data=table(data)
data[data>10]=11
massstatn <- with(hist(data, breaks=seq(0, 11, by = 1), plot=false),
                     data.frame(n=counts, mass=pairjoin(breaks), pct=counts/sum(counts)))
massstatn
massstatn$mass=factor(massstatn$mass,levels = massstatn$mass,order=t)
pn=ggplot(data=massstatn, aes(x=mass, y=n))  
  geom_bar(fill="#4daf4a",alpha = .9, stat="identity",width=0.8)  
  geom_text(aes(x=mass,y=n 20,label=n)) 
  guides(fill=false) 
  theme(legend.key = element_blank(),legend.title = element_blank()
  )   xlab("peptide number") ylab("protein number")  ggtitle("peptide number distribution")
pn

“怎么用r语言统计相同id出现的频率”的内容就介绍到这里了,感谢大家的阅读。如果想了解更多行业相关的知识可以关注本站网站,小编将为大家输出更多高质量的实用文章!

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